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[传染病] 冠状病毒

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发表于 2020-1-29 12:42:58 | 显示全部楼层 |阅读模式
冠状病毒是引起哺乳动物和鸟类疾病的一组病毒。在人类中,该病毒可引起呼吸感染,通常是轻度的呼吸道感染,包括普通感冒,但罕见的形式如SARS和MERS可能具有致命性。在牛和猪中,它们可能引起腹泻,而在鸡中,则可能引起上呼吸道疾病。没有批准用于预防或治疗的疫苗或抗病毒药物。

冠状病毒是按冠状病毒科的冠状病毒科Orthocoronavirinae亚科病毒。[4] [5]冠状病毒是具有正向单链RNA基因组且具有螺旋对称核衣壳的包膜病毒。冠状病毒的基因组大小约为26至32千个碱基,是RNA病毒最大的。

“冠状病毒”的名称源自拉丁语corona,意为冠状或晕状,是指病毒颗粒(病毒体)的特征外观:它们具有让人联想起王冠或日冕的边缘。


冠状病毒颗粒的电子显微照片

内容
1 发现
2 名称和形态
3 复制
4 分类
5 进化
6 人类冠状病毒
6.1 严重急性呼吸系统综合症(SARS)
6.2 中东呼吸综合征
6.3 新型冠状病毒(2019-nCoV)
7 其他动物
7.1 引起的疾病
7.2 在家畜中
8 参考

发现
冠状病毒是在1960年代发现的; [6]最早发现的是鸡中的传染性支气管炎病毒和人感冒的人鼻腔中的两种病毒,其后分别命名为人冠状病毒229E和人冠状病毒OC43。[7] 此后已发现该家族的其他成员,包括2003年的SARS-CoV,2004年的HCoV NL63、2005年的HKU1、2012年的MERS-CoV和2019年的nCoV; 其中大多数与严重的呼吸道感染有关。

名称和形态
名称“冠状病毒”源自拉丁语冠和希腊语κορ**νη(kornē,“花环,花环”),意为冠或光环。这是指通过电子显微镜观察的病毒体(病毒的感染形式)的特征外观,该病毒体的边缘带有较大的球状表面突起,形成的图像让人联想起王冠或日冕。这种形态是由病毒刺突(S)peplomers产生的,它们是在病毒表面填充并决定宿主嗜性的蛋白质。

构成所有冠状病毒总体结构的蛋白质是刺突(S),包膜(E),膜(M)和核衣壳(N)。在SARS冠状病毒的特殊情况下(见下文),S上定义的受体结合结构域介导病毒与其细胞受体血管紧张素转化酶2(ACE2)的结合。[8]一些冠状病毒(特别是β冠状病毒亚组A的成员)也具有称为血凝素酯酶(HE)的较短的穗状蛋白。[4]

复制


冠状病毒的感染周期
该病毒进入细胞后,病毒颗粒未包被,RNA基因组沉积到细胞质中。

冠状病毒RNA基因组具有一个5'甲基化帽和一个3'聚腺苷酸尾巴。这使RNA附着在核糖体上进行转移。

冠状病毒还具有在其基因组中编码的称为复制酶的蛋白质,该蛋白质使RNA病毒基因组可以使用宿主细胞的机制转录为新的RNA副本。复制酶是第一个被制造的蛋白质。一旦编码复制酶的基因被转移,转移就会被终止密码子终止。这称为嵌套抄本。当mRNA转录物仅编码一个基因时,它是单顺反子。冠状病毒非结构蛋白为复制提供了额外的保真度,因为它具有校对功能,[9]仅在依赖RNA的RNA聚合酶中缺乏。

复制了RNA基因组,并形成了一个长的多蛋白,所有蛋白都附着在那里。冠状病毒具有非结构蛋白-蛋白酶-能够分离链中的蛋白。这是该病毒的一种遗传经济形式,允许它以少量核苷酸编码最多数量的基因。[10]

分类
属:α冠状病毒;类型种类:α冠状病毒1 [11] [12]
种类:羊驼冠状病毒,α冠状病毒1,人类冠状病毒229E,人类冠状病毒NL63,小鳞翅目蝙蝠冠状病毒1,小鳞翅目蝙蝠冠状病毒HKU8,猪流行性腹泻病毒,鼻鼻蝠蝙蝠冠状病毒HKU2,Scotophilus Bat冠状病毒512
β冠状病毒属;类型种类:鼠冠状病毒
物种:β冠状病毒1,人冠状病毒HKU1,鼠冠状病毒,Pipistrellus Bat冠状病毒HKU5,Rousettus蝙蝠冠状病毒HKU9,SARS冠状病毒,Tylonycteris蝙蝠冠状病毒HKU4,MERS-CoV,人冠状病毒OC43,刺猬冠状病毒1(EriCoV)-2019 nCoV)
γ冠状病毒属;类型种类:禽冠状病毒
种类:禽冠状病毒,白鲸鲸冠状病毒SW1,鸭冠状病毒,传染性支气管炎病毒
三角冠状病毒属;类型种:球状冠状病毒HKU11
种类:球状冠状病毒HKU11,穆尼亚冠状病毒HKU13,鹅口疮冠状病毒HKU12

演化
冠状病毒的最新共同祖先是在公元前8000年。[13]他们可能比这大得多。另一项估计是所有冠状病毒的最新共同祖先(MRCA)大约在公元前8100年出现。[14] α冠状病毒,β冠状病毒,γ冠状病毒和三角洲冠状病毒的MRCA分别位于大约2400 BCE,3300 BCE,2800 BCE和3000 BCE。蝙蝠和鸟类是温血飞行的脊椎动物,是冠状病毒基因源的理想宿主(蝙蝠是α冠状病毒和β冠状病毒,蝙蝠是γ冠状病毒和三角洲冠状病毒),可以促进冠状病毒的进化和传播。**

牛冠状病毒和犬呼吸道冠状病毒于1951年脱离共同祖先。[15]牛冠状病毒和人类冠状病毒OC43在1899年分离。牛冠状病毒在18世纪末从马冠状病毒物种中分离出来。另一估计表明,人类冠状病毒OC43在1890年与牛冠状病毒分离。[16]

人类冠状病毒OC43的MRCA可以追溯到1950年代。[17]

中东呼吸综合症冠状病毒尽管与几种蝙蝠物种有关,但似乎与这几个世纪以前有所不同。[18]人类冠状病毒NL63和蝙蝠冠状病毒在563–822年前共享了MRCA。[19]

最为紧密相关的蝙蝠冠状病毒和SARS冠状病毒在1986年发生了分歧。[20]已经提出了SARS病毒的进化途径以及与蝙蝠的密切关系。[21] [22]作者认为,冠状病毒已经与蝙蝠共同进化了很长时间,SARS病毒的祖先首先感染了河马科的物种,随后又传播到了鼻犀科,然后又扩散到了香椿,最后又扩散到了人类。**

1960年以前,羊驼冠状病毒和人类冠状病毒229E有所分歧。[23]

人冠状病毒
据信,冠状病毒可引起成年人和儿童的所有普通感冒的很大一部分。冠状病毒会引起感冒,并带有主要症状,例如发烧,主要是在冬季和早春季节,喉咙的腺样体肿胀。[24]冠状病毒可引起肺炎,可为直接病毒性肺炎或继发性细菌性肺炎,也可引起支气管炎,可为直接病毒性支气管炎或继发性细菌性支气管炎。[25]在2003年发现的广为宣传的人类冠状病毒SARS-CoV引起严重的急性呼吸道综合症(SARS),具有独特的发病机理,因为它引起上下呼吸道感染。[25]

人类冠状病毒有七种:

人冠状病毒229E(HCoV-229E)
人冠状病毒OC43(HCoV-OC43)
SARS冠状病毒
人冠状病毒NL63(HCoV-NL63,纽黑文冠状病毒)
人冠状病毒HKU1
中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV),以前称为新型冠状病毒2012和HCoV-EMC。
新型冠状病毒(2019-nCoV),[26] [27]也称为武汉肺炎或武汉冠状病毒。[28] (在这种情况下,“ Novel”表示新发现或新创建的,并且是一个占位符名称。)[27]
冠状病毒HCoV-229E,-NL63,-OC43和-HKU1在人类中不断传播,并在全世界成人和儿童中引起呼吸道感染。[29]

严重急性呼吸系统综合症(SARS)
主条目:严重急性呼吸系统综合症
2003年,继去年开始在亚洲爆发的严重急性呼吸道综合症(SARS)以及世界其他地方的继发病例之后,世界卫生组织(WHO)发布了一份新闻稿,指出一种新的冠状病毒被一种许多实验室是SARS的病因。该病毒正式命名为SARS冠状病毒(SARS-CoV)。超过8,000人被感染,其中约10%死亡。[8]

中东呼吸综合征
主条目:中东呼吸综合征
2012年9月,确定了一种新型冠状病毒,最初称为2012年新型冠状病毒,现在正式命名为中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)。[30] [31]不久之后,世界卫生组织发布了全球警报。[32]世卫组织在2012年9月28日的更新中指出,该病毒似乎在人与人之间不易传播。[33]然而,2013年5月12日,法国社会事务和卫生部确认了在法国发生的人传人病例。[34]此外,突尼斯卫生部还报告了人际传播病例。有两个确诊病例涉及似乎是从已故父亲那里传染病的人,他们在访问卡塔尔和沙特阿拉伯后病了。尽管如此,由于大多数被感染的人不会传播病毒,因此该病毒似乎难以在人与人之间传播。[35]截至2013年10月30日,沙特阿拉伯共有124例案件和52例死亡。[36]

荷兰伊拉斯ras医学中心对该病毒进行测序后,该病毒被重新命名为人类冠状病毒伊拉斯ras医学中心(HCoV-EMC)。该病毒的最终名称是中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)。 2014年5月,美国仅记录了2例MERS-CoV感染病例,都发生在沙特阿拉伯工作然后前往美国的医护人员中。其中1例在印第安纳州接受治疗,另一例在佛罗里达州接受治疗。这两个人都暂时住院,然后出院。[37]

2015年5月,大韩民国爆发了中东呼吸综合征冠状病毒,当时一名男子前往中东,前往首尔地区的4家不同医院进行治疗。 这是中东以外发生的最大的MERS-CoV疫情之一。[38] 截至2019年12月,实验室检测已确认2 468例MERS-CoV感染,其中851例死亡,死亡率约为34.5%。[39]

新型冠状病毒(2019-nCoV)

冠状病毒的横断面模型
据报道,2019年12月在中国武汉爆发了肺炎。 2019年12月31日,疫情追溯到一种新型冠状病毒,[40]被世界卫生组织(WHO)标记为2019-nCoV。[26] [27] [41]

到2020年1月28日,该冠状病毒肺炎暴发已报告了130多例死亡和5570多例确诊病例。[42] [43] [44] [45]武汉株已被鉴定为来自2B组的新的β冠状病毒株,与SARS-CoV的遗传相似性约为70%。[46]该病毒被怀疑起源于蛇,[47]但许多领先的研究人员不同意这种观点。[48]

其他动物
自1970年代初以来,冠状病毒已被认为是引起兽医疾病的原因。除禽类传染性支气管炎外,主要相关疾病主要位于肠道。[49]

引起的疾病
冠状病毒主要感染哺乳动物和鸟类的上呼吸道和胃肠道。它们还会在农场动物和家养宠物中引起一系列疾病,其中某些疾病可能很严重,并威胁到农业产业。在鸡中,冠状病毒是一种传染性支气管炎病毒(IBV),不仅针对呼吸道,而且还针对泌尿生殖道。该病毒可以传播到整只鸡的不同器官。[50]农场动物具有经济意义的冠状病毒包括猪冠状病毒(可传播的胃肠炎冠状病毒,TGE)和牛冠状病毒,它们都会导致幼小动物的腹泻。猫冠状病毒:猫肠冠状病毒有两种形式,一种临床意义较小的病原体,但这种病毒的自发突变可导致猫传染性腹膜炎(FIP),这是一种与高死亡率相关的疾病。类似地,有两种类型的冠状病毒感染雪貂:雪貂肠冠状病毒会引起胃肠道综合症,称为流行性卡他性肠炎(ECE),而致命性更强的全身病毒版本(如猫中的FIP)在雪貂中称为雪貂全身性冠状病毒。 (FSC)。[51]犬冠状病毒有两种类型,一种引起轻度胃肠疾病,另一种被发现引起呼吸系统疾病。小鼠肝炎病毒(MHV)是一种冠状病毒,可引起流行性鼠疫,死亡率很高,尤其是在实验室小鼠的殖民地中。[52]唾液酸腺腺炎病毒(SDAV)是实验室大鼠的高感染性冠状病毒,可以通过直接接触在个体之间传播,也可以通过气溶胶间接在个体之间传播。急性感染对唾液,泪腺和硬性腺的发病率和嗜性较高[53]

一种与HKU2相关的蝙蝠冠状病毒,称为猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV),可引起猪腹泻。[54]

在发现SARS-CoV之前,无论是在体内还是体外,以及在分子水平上,MHV都是研究最完善的冠状病毒。一些MHV病毒株在小鼠中引起进行性脱髓鞘性脑炎,其已被用作多发性硬化的鼠模型。大量研究工作集中在阐明这些动物冠状病毒的病毒发病机理,特别是对兽医和人畜共患病感兴趣的病毒学家。[55]

在家畜中
传染性支气管炎病毒(IBV)引起禽类传染性支气管炎。
猪冠状病毒(猪传染性胃肠炎冠状病毒,TGEV)。[11] [12]
牛冠状病毒(BCV),引起幼小牛严重的大肠炎。
猫冠状病毒(FCoV)会引起猫轻度肠炎以及严重的猫传染性腹膜炎(同一病毒的其他变体)。
两种类型的犬冠状病毒(CCoV)(一种引起肠炎,另一****种在呼吸系统疾病中发现)。
其冠状病毒(TCV)引起火鸡肠炎。
雪貂肠道冠状病毒在雪貂中引起流行性卡他性肠炎。
雪貂全身性冠状病毒在雪貂中引起FIP样全身综合征。[56]
Pantropic犬冠状病毒。
兔肠道冠状病毒在欧洲幼兔中引起急性胃肠道疾病和腹泻。死亡率很高。[57]
另一种新的兽医疾病,即猪流行性腹泻病毒(PED或PEDV),已在世界范围内出现。**其经济重要性尚不清楚,但在仔猪中却显示出高死亡率。**

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